Die Veröffentlichung von 2.000 Hundegenomen bietet ein Toolkit für die translationale Forschung

Die in der Zeitschrift Genome Biology veröffentlichte Studie beschreibt das Toolkit-Ressourcenpaket und stellt die ersten Entdeckungen vor.

Die Veröffentlichung ist das Ergebnis der Bemühungen des Dog10K-Konsortiums, das aus 48 Wissenschaftlern aus 25 Einrichtungen besteht, die Proben und Ressourcen zu dem immensen analytischen Aufwand beisteuern.

"Das Ziel war es, eine Ressource zu erstellen, auf die die weltweite Gemeinschaft zugreifen kann und die sie nutzen können, um die Umsetzung ihrer eigenen Forschung zu beschleunigen, sei es bei der Untersuchung der gemeinsamen Vorfahren von Hunden und Wölfen oder bei der klinischen Behandlung von Krebserkrankungen. All diese Möglichkeiten sind spannend, und alle können vom Dog10K-Katalog profitieren", sagt Jennifer Meadows, wissenschaftliche Mitarbeiterin an der Universität Uppsala und leitende Mitautorin der Studie.

Die Stärke der Dog10K-Analysen liegt in der Tiefe der genetischen Vielfalt, die das Team erfassen konnte. Die Hundeproben stammten von mehr als 320 der rund 400 anerkannten Rassehunderassen sowie von Nischenpopulationen von Dorfhunden, Wölfen und Kojoten.

Daraus entwickelte das Team:

"Wir haben gerade erst an der Oberfläche des Potenzials der Daten gekratzt", so Meadows weiter. "Es gibt noch mehr genetische Vielfalt bei Hunden, Wölfen und Kojoten zu entdecken, aber das Dog10K-Team freut sich darauf zu sehen, wie diese erste Anstrengung von der Hundewissenschaft genutzt wird."

Diese Phase des Dog10K-Konsortiums wurde durch mehrere Zuschüsse unterstützt, unter anderem von den National Institutes of Health (USA), der Chinesischen Akademie der Wissenschaften, der Jane und Aatos Erkko Stiftung, dem Europäischen Forschungsrat und dem Schwedischen Forschungsrat. Dr. Jennifer Meadows (Universität Uppsala) und Dr. Jeffery Kidd (Universität Michigan) sind die Co-Leitautoren der Studie, während Dr. Ya-Ping Zhang (Chinesische Akademie der Wissenschaften, China) und Dr. Elaine Ostrander (National Human Genome Research Institute (NIH)) die Co-Senior-Autoren sind.

Publikation

Meadows et al. (2023) Genome sequencing of 2000 canids by the Dog10K consortium advances the understanding of demography, genome function and architecture , Genome Biology, DOI: 10.1186/s13059-023-03023-7